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실손의료보험금을 청구했는데 예상보다 적게 들어왔다면? 그 원인은 세액공제를 받은 의료비가 차감되었기 때문일 수 있습니다.
이 글에서는 2025년 기준 세법에 따라 실손보험금이 왜 차감되는지, 그리고 이를 복구하기 위한 수정신고 절차까지 상세하게 안내드립니다.
목차
- 실손의료보험금이 차감되는 이유
- 2025년 의료비 세액공제율과 한도
- 차감 여부 확인 방법
- 수정신고로 돌려받는 방법
- 실제 예시로 이해하는 절세 전략
- 자주 묻는 질문(FAQ)
- 최종 정리
1. 실손의료보험금이 차감되는 이유
연말정산 또는 종합소득세 신고 시 의료비 세액공제를 받았다면, 해당 금액은 중복 지원을 막기 위해 실손보험금 청구 시 제외됩니다.
이걸 기납입 의료비 차감이라고 하며, 보험사는 국세청과 연동된 데이터를 기준으로 차감액을 계산합니다.
즉, 세액공제 받은 의료비는 실손보험금에서 반드시 제외되어야 하며, 이를 누락하면 추후 가산세가 부과될 수 있습니다.
2. 2025년 의료비 세액공제율과 한도
- 총급여 7,000만 원 이하: 15% 세액공제
- 총급여 7,000만 원 초과: 12% 세액공제
- 공제 한도: 본인 부담 의료비 중 연간 700만 원까지 세액공제 가능
3. 차감 여부 확인 방법

- 보험금 지급명세서 확인: “세액공제 대상 의료비 차감” 문구 확인
- 홈택스 > 연말정산 간소화: 의료비 항목에서 실손보험금 수령 내역 확인
TIP! 2021년부터 연말정산 간소화 서비스에서 실손보험금 자료가 자동 제공되어, 별도 증빙서류 제출 없이 홈택스에서 바로 확인 가능합니다.
경로: 홈택스 로그인 > 연말정산간소화 > 소득·세액공제 자료조회 > 의료비
경로: 홈택스 로그인 > 연말정산간소화 > 소득·세액공제 자료조회 > 의료비
4. 수정신고로 돌려받는 방법
실손보험금 차감 사유가 세액공제 중복이라면, 국세청 홈택스에서 종합소득세 수정신고를 통해 의료비 공제 금액을 정정할 수 있습니다.
이후 보험사에 재청구하면 차감됐던 금액을 받을 수 있습니다.
- 홈택스 접속 후 “신고/납부” > “종합소득세” > “정기신고서 수정” 선택
- 기존 신고 내용 불러오기 후 의료비 항목 수정
- 실손보험 수령액을 제외한 금액만 공제로 남기고 재제출
- 수정신고 후 보험사에 차감액 재청구
※ 보험금 재청구는 보험사별로 청구 기한이 다르니 반드시 확인하세요.
5. 실제 예시로 이해하는 절세 전략
예시:
2024년 병원비 300만 원 지출, 실손보험으로 100만 원 수령 시
실제 공제 가능한 의료비 = 300만 원 - 100만 원 = 200만 원
이 차액을 반영하지 않고 공제 받았다면, 세액 과다공제가 되고 보험금 수령액도 줄어듭니다.
2024년 병원비 300만 원 지출, 실손보험으로 100만 원 수령 시
실제 공제 가능한 의료비 = 300만 원 - 100만 원 = 200만 원
이 차액을 반영하지 않고 공제 받았다면, 세액 과다공제가 되고 보험금 수령액도 줄어듭니다.
6. 자주 묻는 질문(FAQ)
- Q. 실손보험으로 받은 금액은 무조건 공제 대상에서 제외되나요?
A. 네, 세법상 실손보험으로 받은 금액은 의료비에서 공제 대상에서 제외되어야 합니다. 중복 공제를 방지하기 위함입니다. - Q. 수정신고는 어떤 상황에서 꼭 해야 하나요?
A. 의료비 공제 시 실손보험금 수령액을 제외하지 않고 세액공제를 받은 경우, 수정신고를 통해 바로잡아야 합니다. 그렇지 않으면 보험금 청구액이 줄거나, 세금 환급에 오류가 발생할 수 있습니다. - Q. 수정신고하면 세금을 더 내야 하나요?
A. 세금을 새로 내는 것이 아니라, 공제 항목을 조정하는 것이므로 기존보다 환급이 줄어드는 정도로 조정됩니다.
7. 최종 정리
2025년 기준 세법에 따라 실손의료보험과 세액공제는 명확히 구분해야 하며, 중복 공제 방지를 위해 실손보험 수령액은 공제 대상에서 반드시 제외되어야 합니다.
수정신고를 통해 정정할 경우 보험금 재청구가 가능하니, 실손보험금과 의료비 공제 내역을 꼼꼼히 확인해두세요.
관련 키워드: 종합소득세, 의료비 공제, 실손보험 청구, 수정신고, 세액공제, 절세 전략
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